Совещание по вопросам терроризма, которое проводилось в Генеральном штабе, было прервано уведомлением от МIТ.
К окончанию совещание, которое последовало за уведомлением из MIT, были завершены процедуры, связанные с первым из четырех указаний, отправленных во все подразделения вооруженных сил – запрет на полеты. В результате чего 36 самолетов, находящиеся в воздухе вернулись на свои авиабазы.
С началом попытки государственного переворота в Генеральном штабе начались напряженные часы. Сначала были расстреляны некоторые сотрудники службы охраны главы Генерального штаба генерала Акара. Заместитель Акара подполковник Левент Тюрккан, заместитель денщика капитан Сердар и сотрудники спецназа вошли в кабинет генерала Акара и пытались взять его под стражу. Угрожая оружием, они пытались заставить его подписать декларацию о государственном перевороте. После чего при помощи пояса начали душить Акара, который отказался подписать декларацию. Тем временем заместитель главы Генерального штаба генерала Яшар Гюлер под угрозой оружия был захвачен в заложники одним из офицеров его команды.
Сотрудники службы безопасности здания Аппарата Примьер-Министра в Кызылай, услышав выстрелы из Генерального штаба, где-то в 21.35 передала эту информацию в Координационный центр премьер-министра. После этого уведомления Аппарат Примьер-Министра связался с Центром управления командованием Вооруженных Сил, однако официальные лица управления сказали, что выстрелы вызваны военными учениями.
После этих чрезвычайных событий командующий сухопутными войсками генерал Салих Зеки Колак позвонил главе Генерального штаба Хулуси Акару. Трубку поднял помощник Акара подполковник Левент Тюрккан. Тюрккан вызвал Чолака в Генштаб, сказав: «Глава Генерального штаба ждет вас, и особенно начальника штаба сухопутных войск генерала Ихсана Уйяра в Генштаб». По прибытию, у входа в Генеральный штаб Чолак и генерал Уйяр были захвачены путчистами. Старший сержант Бюлент Айдын, который пытался предотвратить это, был убит путчистами. Кроме того, был ранен начальник службы безопасности капитан Бурак Акын. Бюлент Айдын вошел в историю как первый мученик попытки государственного переворота. Глава Генштаба Акар на вертолета был перевезен на авиабазу Акынджи.
После чрезвычайной мобильности в штаб-квартире Национальной разведывательной организации (MIT) и собрания, проводимом в Генеральном штабе, заговорщики поняли, что их план переворота был раскрыт. Заговорщики, изменив время начала государственного переворота на более раннее, приступили к осуществлению всех этапов плана «Операция Молния», которую они планировали провести в 03.00, 16 июля.