Cumhurbaşkanlığı Hükümet Sistemi’ne geçişte ekonomiyle ilgili bakanlık, kurum ve kuruluşların yapıları, görev ve yetkilerinde değişikliğe gidildi. Yeni sisteme ilişkin mevzuatta düzenlemesini içeren703 sayılı Kanun Hükmünde Kararname (KHK), Resmi Gazete’nin dünkü mükerrer sayısında yayımlandı. Yeni dönemde; Ekonomik ve Sosyal Konseyin Başkanı Cumhurbaşkanı olurken, konseyin üyeleri Cumhurbaşkanı tarafından belirlenecek.
Maliye Bakanlığı adı “Hazine ve Maliye Bakanlığı” olurken, Ulaştırma, Denizcilik ve Haberleşme Bakanlığı, düzenlemeyle Ulaştırma ve Altyapı Bakanlığı adıyla göreve devam edecek. Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığının adı Sanayi ve Teknoloji Bakanlığı oldu. Gümrük ve Ticaret Bakanlığına ilişkin düzenlemelerde ise Ticaret Bakanlığına atıf yapıldı.
Türkiye Cumhuriyet Merkez Bankası Kanunu’nda da önemli değişiklikler yapıldı. Merkez Bankasının hükümetle ilişkisi, Cumhurbaşkanı veya görevlendireceği bir bakan aracılığıyla da sağlanacak. Para Politikası Kuruluna ilişkin olarak, Merkez Bankası Başkanın önerisi üzerine atanacak üyeye ilişkin “müşterek kararla” ibaresi metinden çıkarıldı. Başkan yardımcıları için aranan “meslekleri ile ilgili olarak en az 10 yıl çalışmış” olma şartı ile “Başkanın önerisi üzerine müşterek kararla 5 yıl süre ile atanacağına ilişkin ibare yeni metinde yer almadı.
Tanıtma Fonu Cumhurbaşkanı’nın emrine verilirken, Fonun sekretarya hizmetleri Cumhurbaşkanı’nca görevlendirilecek bakanlık veya kurum tarafından yerine getirilecek. Özelleştirme Yüksek Kurulunca görülmekte olan işler Cumhurbaşkanı veya yetkilendireceği makam tarafından sonuçlandırılacak.